单细胞RNA-seq(single cell RNA-seq, scRNA-seq)是目前用于细胞类型、细胞状态研究的核心工具,很多实验室也同时围绕scRNA-seq技术建立了多种计算方法并且优化了建库方法,不同方法在如...
染色体外环状DNA:肿瘤研究新方向
染色体外环状DNA(ecDNA)是癌症中活化原癌基因扩增的主要方式。区别于常染色体,这类生物大分子主要以环状的形式存在于细胞核当中,长度分布在10的3次方到6次方数量级,无中心粒。ecDNA序列中包含一个或者多个基因与调...
机器学习遇到单细胞组学:Perturbation Modeling
细胞生物学的相关研究一直受限于数据的完整性和表型的完整性,对应激状态和稳态下的细胞区别观察不够充分。过去五年中,计算机视觉和语音识别领域通过对大量的无标签数据进行学习、建模,很好的解决了数据不足的问题。同样在最近的研究中...
RNA m6A修饰问题汇总(第一期)
RNA m6A修饰无疑是表观转录组学中最受关注的研究内容之一,目前的研究已经表明,m6A可能影响mRNA的运输、降解、翻译以及代谢等方方面面,这种转录后修饰参与多种病理生理过程。mRNA m6A研究该注意哪些问题?高通量...